Las agencias nacionales ejecutoras del programa son la Sociedad Rural Argentina (SRA), el Instituto de Estudios de Comercio y Negociaciones Internacionales (ICONE) en Brasil, que a la vez ejerce la coordinación regional, la Cámara Paraguaya de Exportadores de Cereales y Oleaginosas (CAPECO) y la Asociación Rural del Uruguay (ARU).

 Instituto de Estudios de Comercio y Negociaciones Internacionales (ICONE) en Brasil.

El Instituto de Estudios de Comercio y Negociaciones Internacionales (ICONE) es una asociación civil independiente y sin fines de lucro fundada en marzo de 2003 por iniciativa y con apoyo de las siguientes asociaciones privadas de Brasil: la Federación de Industrias del Estado de San Pablo (FIESP-CIESP), la Unión de Agroindustria de Caña de Azúcar del Estado de San Pablo (UNICA), el Instituto de Arroz de Río Grande (IRGA), Industrias de Aceites Vegetales (ABIOVE), la Asociación Brasileña de Productores y Exportadores de Pollo (ABEF), la Asociación Brasileña de Agronegocios (ABAG) y la Asociación Brasileña de Industrias Exportadoras de Carne (ABIEC).

Su objetivo principal es apoyar las negociaciones internacionales, particularmente en el sector agroindustrial, para contribuir en la profundización de la integración de Brasil al resto del mundo. Cuenta con una amplia experiencia de preparación y presentación de estudios de impacto de los procesos de integración sobre determinados sectores y su opinión técnica es frecuentemente requerida por la prensa, expertos internacionales y altos funcionarios de gobiernos.

 Sociedad Rural Argentina (SRA)

La Sociedad Rural Argentina es una asociación privada, sin fines de lucro. Su objetivo es fomentar y promover el desarrollo agropecuario. Cuenta con más de 6.500 asociados, entre los que se encuentran grandes, medianos y pequeños productores diseminados por todo el territorio ar-gentino. Participan más de 260 delegados zonales y 103 Sociedades Rurales adheridas a su Consejo Federal, que junto a sus 50 directores garantizan su representatividad nacional.

A través del Instituto de Negociaciones Internacionales, la SRA brinda su aporte en las negocia-ciones internacionales y tiene un activo desempeño en los organismos internacionales.

La  Sociedad Rural Argentina (SRA) firmó acuerdos de colaboración con la Fundación Instituto para las Negociaciones Agrícolas Internacionales (INAI) y las respectivas bolsas, la Bolsa de Cereales de Buenos Aires (BCBA), la Bolsa de Comercio de Rosario (BCR), la Bolsa de Cereales de Bahía Blanca (BCBB), Confederaciones Rurales Argentinas (CRA), el Centro de la Industria Lechera (CIL). A la vez, suscribió un convenio de colaboración con la Federación Agraria Argentina (FAA).

 Asociación Rural del Uruguay (ARU)

La Asociación Rural del Uruguay fue fundada en 1871. Es una asociación privada, sin fines de lucro, de carácter nacional e integrada por productores. Tiene por objeto la defensa y el fomento de los intereses de la producción agraria, de industrias complementarias y derivadas y la promo-ción de los trabajadores rurales.

La Asociación Rural de Uruguay (ARU) firmó acuerdos de colaboración con la Cámara de Indus-trias (CIU) y la Cámara Mercantil de Productos del País (CPMM).

 Cámara Paraguaya de Exportadores de Cereales y Oleaginosas (CAPECO)

La Cámara Paraguaya de Exportadores de Cereales y Oleaginosas (CAPECO) fue fundada en 1981 y agrupa a los principales exportadores de cereales y oleaginosas. Su misión es concentrar a las empresas para cooperar integralmente en el desarrollo de sus intereses.

Brinda apoyo a los programas de difusión de la Siembra Directa, desarrolla programas de investigación en conjunto con el Ministerio de Agricultura y Ganadería y organismos internacionales para el mejoramiento de semillas, calidad de granos, fertilización de suelos, control de enfermedades y mejoramiento de cultivos. También elabora programas de financiación, realiza búsquedas de nuevos mercados para granos y sus derivados, negocia accesos de preferencia e impulsa la fluidez en el transporte.